Cara Membaca Scatter Plot Dalam Program MVSP: Analisis PCA dengan MVSP

Cara Membaca Scatter Plot Dalam Program MVSP: Analisis PCA dengan MVSP

MVSP (MultiVariate Statistical Package) adalah salah satu aplikasi yang sering digunakan oleh seorang biologis, terutama yang fokus pada bidang taksonomi. Aplikasi ini merupakan aplikasi berbayar, tetapi kita dapat menggunakan versi Trialnya selama 30 hari. Berikut adalah cara menggunakan MVSP dengan analisis PCA (Principal Component Analysis).

Langkah-Langkah Menggunakan MVSP untuk Analisis PCA

  1. Pilih "New" untuk membuat Project baru.
  2. Masukkan Jumlah Karakter dan Jumlah Total Sampel:
  • Variable: jumlah karakter
  • Cases: jumlah total seluruh sampel
    Oke
  1. Tampilan berikutnya >>>
  2. Edit data yang akan digunakan untuk dianalisis:
  • Data >> Edit Data
  1. Tampilan Berikutnya >>>
  2. Tambahkan Group data:
  • Data >> Add Group
    Muncul kotak dialog Data Group >> Masukkan nama group data (populasi)
    Telan enter setelah selesai mengetikan satu nama group >>
    Tekan “+” untuk menambahkan group
  1. Tampilan Berikutnya >>>
  2. Kolom A: isikan nomor urutan sampel dari 1-150
    Kolom B: Group (diisikan sesuai dengan nomor urut sampel)
  • 1-50 >> kiri
  • 51-100 >> kanan
  • 101-150 >> batang alai

    Tutup “X” kotak dialog data group

  1. Baris 1 pada kolom C, D, E dst diketikkan nama karakter yang diukur (copy paste dari excel)

  2. Dilakukan input keseluruhan data sesuai lokasi dan karakter yang diukur (copy paste dari excel)
    Data yang diinput adalah data rasio terhadap panjang standar

  3. Analysses >> Principal Components…

  4. Sesuaikan isian pada kotak dialog PCA Analisis Option >> OK

  5. Tampilan hasil analisis PCA

  6. Graph >> Scatter Plot

  7. Sesuaikan isian pada kotak dialog Create PCA graph >> OK

  8. Tampilan Grafik hasil analisis PCA

  9. Graph >> Edit Graph (untuk mengubah tampilan grafik)

  10. Menyimpan gambar analisis PCA:

  • File >> Export >> simpan dalam dua bentuk penyimpanan (wmf dan bmp)
  1. Minimize tampilan layar gambar PCA

  2. Copy data hasil analysis PCA ke file Excel secara manual (copy paste)

    Bold kan data sesuai dengan hasil analysis PCA pada program MVSP
    Save

  3. File >> Save data As >> Save

  4. Simpan data:

  • File >> Save Data As >> Save
  1. Minimize jendela Principal Component Analysis

Referensi:

  1. Marsha, Ruhama Maya Sari (2020). Tutorial MVSP. Jakarta: Universitas Indonesia.
  2. MVSP Documentation. (n.d.). MultiVariate Statistical Package User Guide. Retrieved from https://www.mvsp.com/user-guide/

Dengan demikian, Anda dapat menggunakan program MVSP untuk melakukan analisis PCA dan membuat scatter plot untuk visualisasi hasil analysis.