Dalam dua dekade terakhir, teknologi Small-Angle X-ray Scattering (SAXS) telah mendapatkan kesuksesan dan popularitas yang besar dalam penelitian biologis. Hal ini disebabkan oleh kemajuan sumber sinar-X brilliant, detektor luas, serta metode analisis data yang lebih baik. Tujuan dari "Mengembangkan Kemampuan Analisis Data Bio-SAXS: Melampaui Teori Rg" adalah untuk meningkatkan kesadaran dan kemampuan masyarakat biologi struktural dalam menggunakan teknologi SAS dengan memberikan kursus tingkat menengah bagi mereka yang memerlukan pemahaman lebih baik tentang teori, metode, dan fasilitas yang tersedia di APS.
Kursus ini membahas teori, metode, dan kemampuan SAS untuk biologi struktural, serta alat analisis data yang dapat membantu masyarakat menulis proposal beam-time yang efektif dan menggunakan sumber daya di APS secara lebih baik. Meskipun beberapa metode yang dibahas dalam kursus ini awalnya dikembangkan untuk molekul biomolekuler yang sering memiliki monodispersitas, kursus ini juga dapat bermanfaat bagi mereka yang bekerja dengan contoh cairan yang memiliki homogenitas struktural tinggi. Namun, kursus ini TIDAK SESUAI untuk material lunak yang polidispers.
Kursus ini terdiri atas kuliah, latihan software, serta sesi eksperimen tangan. Sesi eksperimen dilakukan di beamline SAS APS yang dipilih untuk contoh-contoh yang dibawa oleh peserta dan demo sample. Contoh data akan disediakan untuk latihan software. Pembicara akan tersedia selama latihan software dan sesi eksperimen untuk diskusi satu-satu.
Peserta diharapkan memiliki pendidikan minimal tingkat sarjana dan sangat disarankan untuk memiliki program eksperimen yang jelas, sehingga mereka dapat mengumpulkan data untuk beberapa contoh yang dibawa. Peserta juga diharapkan membawa laptop-nya sendiri (Windows atau MacOS).
SILABUS
- Fundamentals of Small-Angle Scattering
- Theories and Applications of Bio-SAXS
- Bio-SAXS Sample Preparation
- Small Angle Scattering Instrumentation
- Specific Topics of Bio-SAXS Methods on Various Systems
- Time-Resolved X-ray Scattering
- Software Practice
- Strategies to Write Successful Beam-Time Proposals
Pembicara
- Srinivas Chakravarthy, BioCAT/IIT
- Jan Ilavsky, XSD/Argonne
- Peter R. Jemian, XSD/Argonne
- Tom Irving, BioCAT/IIT
- Soenke Seifert, XSD/Argonne
- Steven Weigand, DND-CAT/Northwestern
- Xiaobing Zuo, XSD/Argonne
- Dan lain-lain staf APS XSD dan APS CAT
Course Objective – Irena & Nika Software
Sukses eksperimen SAXS memerlukan alat reduksi data dan analisis yang tepat. Igor Pro berbasis paket Nika (untuk reduksi data SAXS) dan Irena (untuk analisis data SAXS) telah dikembangkan selama 10 tahun terakhir di APS. Mereka telah digunakan secara luas untuk material, fisika, dan kimia SAXS di APS dan fasilitas lainnya di dunia. Alat-alat ini sering diajarkan dalam "Mengembangkan Kemampuan Analisis Data Bio-SAXS: Melampaui Teori Rg" yang diselenggarakan secara semi-annually oleh APS SAXS SIG (lihat di atas). Namun, kursus ini lebih berfokus pada eksperimen dan teori bagi pengguna SAXS baru. Waktu yang dialokasikan untuk software dalam kursus ini tidak cukup untuk eksperimenter yang memiliki pengalaman tinggi dan ingin menggunakan aplikasi software kompleks.
Kursus ini akan diajar oleh penulis software, Jan Ilavsky, staf APS. Untuk memberikan nilai pendidikan yang lebih tinggi, jumlah peserta akan terbatas menjadi 20. Peserta diharapkan memiliki pengalaman SAS yang tinggi dan membawa laptop-nya sendiri (Windows atau MacOS). Selain itu, mereka sangat disarankan untuk membawa hasil eksperimen SAXS mereka sendiri.
Nota: Kursus ini TIDAK SESUAI untuk material lunak yang polidispers.