Dalam pengembangan program yang menggunakan teknologi MPI (Message Passing Interface) untuk melakukan komunikasi antar-proses, kita seringkali mengalami masalah ketika ingin menggunakan fungsi scatter dan gather dari library mpi4py. Salah satu contoh error adalah KeyError yang terjadi karena data yang di-load dari file input tidak dapat di-handle oleh fungsi scatter.

Dalam artikel ini, kita akan membahas tentang bagaimana mengatasi error pada fungsi scatter dan gather di Python dengan menggunakan library mpi4py.

Contoh 1: Menggunakan Fungsi Scatter

Misalkan kita memiliki data yang ingin dibagi ke semua proses dengan menggunakan fungsi scatter. Kita dapat melihat contoh berikut:

from mpi4py import MPI
import numpy as np

comm = MPI.COMM_WORLD
size = comm.Get_size()
rank = comm.Get_rank()

if rank == 0:
 data = np.empty(size, dtype=object)
else:
 data = None

data = comm.scatter(data, 0) # I work fine!

print("Data on rank %d: " % Rank, data)

Namun, jika kita ingin menggunakan fungsi scatter dengan numpy array, maka kita harus memastikan bahwa tipe data numpy array tersebut sesuai dengan tipe data yang di-handle oleh fungsi scatter. Contoh berikut menunjukkan bagaimana mengatasi error:

d_loc = comm.scatter(d)

Contoh 2: Menggunakan Fungsi Gather

Misalkan kita memiliki beberapa proses yang masing-masing memiliki hasil yang ingin dikumpulkan ke proses master dengan menggunakan fungsi gather. Kita dapat melihat contoh berikut:

X = comm.gather(X, root=0)

Namun, jika kita ingin mengumpulkan data numpy array, maka kita harus memastikan bahwa tipe data numpy array tersebut sesuai dengan tipe data yang di-handle oleh fungsi gather. Contoh berikut menunjukkan bagaimana mengatasi error:

X = comm.gather(X[:,1:], root=0)
 File "mpi4py/MPI/Comm.pyx", line 1578, in mpi4py.MPI.Comm.gather
 File "mpi4py/MPI/msgpickle.pxi", line 773, in mpi4py.MPI.PyMPI_gather
 File "mpi4py/MPI/msgpickle.pxi", line 778, in mpi4py.MPI.PyMPI_gather
 File "mpi4py/MPI/msgpickle.pxi", line 191, in mpi4py.MPI.pickle_allocv
 File "mpi4py/MPI/msgpickle.pxi", line 182, in mpi4py.MPI.pickle_alloc
SystemError: Negative size passed to PyBytes_FromStringAndSize

Solusi

Untuk mengatasi error pada fungsi scatter dan gather, kita dapat mencoba beberapa solusi berikut:

1. Pastikan bahwa tipe data numpy array tersebut sesuai dengan tipe data yang di-handle oleh fungsi scatter dan gather.
2. Periksa apakah ada error lainnya dalam program, seperti error pada file input atau output.
3. Coba menggunakan fungsi mpi4py lainnya, seperti alltoall atau reduce, untuk mengumpulkan data.

Dengan demikian, kita dapat lebih mudah memahami bagaimana mengatasi error pada fungsi scatter dan gather di Python dengan menggunakan library mpi4py.