Pada artikel ini, kita akan belajar bagaimana membuat plot skat dan jalur fitted menggunakan program R. Pertama-tama, kita perlu memahami cara mengatur direktori kerja (working directory) dan membuka file data.
Mengatur Direktori Kerja
Dalam contoh ini, kita akan menggunakan folder "R_work" sebagai direktori kerja. Kami dapat mengatur direktori kerja dengan menggunakan perintah setwd()
:
setwd("C:/1awinz/R_work/scatter_line_ci")
Kita dapat memeriksa apakah direktori kerja telah diatur dengan benar dengan menggunakan perintah getwd()
:
getwd()
Membuka File Data
File data kita adalah file teks yang disimpan dalam format tab-delimited. File tersebut berisi data panjang standar (SL) dan panjang kepala (HL) untuk 50 individu jantan dan betina ikan stickleback anadromous. File data ini dapat diunduh dari GitHub.
Kita akan menggunakan file data "data_RS_SL_HL.txt" sebagai contoh. File tersebut memiliki header (variabel nama) dan dapat dibuka dengan perintah read.table()
:
read.table("data_RS_SL_HL.txt", header=T)
data=read.table("data_RS_SL_HL.txt", header=T)
attach(data)
names(data)
Membuat Plot Skat
Kita akan membuat plot skat yang sederhana menggunakan perintah ggplot()
:
ggplot(data, aes(x=SL, y=HL)) + geom_point()
Perintah ini akan menghasilkan plot skat yang menunjukkan hubungan antara panjang standar (SL) dan panjang kepala (HL) untuk individu ikan stickleback.
Membuat Plot Skat dengan Jalur Fitted
Kita dapat membuat plot skat dengan jalur fitted menggunakan perintah ggplot()
:
ggplot(data, aes(x=SL, y=HL)) + geom_point(aes(color=Sex))+ geom_smooth(method=lm, aes(color=Sex))+theme_classic()
Perintah ini akan menghasilkan plot skat yang menunjukkan hubungan antara panjang standar (SL) dan panjang kepala (HL) untuk individu ikan stickleback, serta jalur fitted untuk setiap jenis seks. Kita juga dapat menggunakan tema kelasik dengan perintah theme_classic()
.
Dengan demikian, kita telah belajar bagaimana membuat plot skat dan jalur fitted dengan R. Kita dapat menggunakan teknik ini untuk menganalisis data dan mencari hubungan antara variabel-variabel.