Dalam beberapa kasus, kita perlu membuat scatter plot dengan menggunakan data dari dua frame. Salah satu contoh adalah ketika kita memiliki dua dataset yang masing-masing memiliki kolom yang ingin digunakan sebagai koordinat x dan y.

Contoh:

Misalkan kita memiliki dua dataframe, df1 dan df2, masing-masing berisi hasil analisis epigenetik. Kita ingin membuat scatter plot dengan menggunakan data dari kedua frame, serta menunjukkan label pada titik-titik yang masing-masing berasal dari frame mana.

Penggunaan Ggplot2:

Kita dapat menggunakan library ggplot2 untuk membuat scatter plot. Berikut adalah contoh kode:

library(ggplot2)

# Buat dua dataframe, df1 dan df2
df1 <- data.frame(beta_ADHD = runif(100, 0, 10))
df2 <- data.frame(beta_ADHD = rnorm(100, 0, 10))

# Buat frame baru yang menggabungkan koordinat dari kedua frame
new_df <- data.frame(x = df1$beta_ADHD, y = df2$beta_ADHD)

# Membuat scatter plot dengan menggunakan ggplot
ggplot(new_df, aes(x = x, y = y)) + 
 geom_point() + 
 labs(x = "beta_ADHD from df1", y = "beta_ADHD from df2")

Dalam kode di atas, kita membuat dua dataframe, df1 dan df2, yang masing-masing berisi data epigenetik. Kemudian, kita membuat frame baru, new_df, yang menggabungkan koordinat dari kedua frame. Akhirnya, kita menggunakan ggplot untuk membuat scatter plot dengan menggunakan data dari frame baru.

Tips:

• Pastikan bahwa dua frame memiliki jumlah baris yang sama, karena scatter plot memerlukan jumlah titik yang sama di semua koordinat.
• Anda dapat mengubah warna dan label pada axis menggunakan fungsi xlab() dan ylab().
• Jika Anda ingin menunjukkan label pada titik-titik, Anda dapat menggunakan fungsi geom_text() atau annotate().

Dengan demikian, kita dapat dengan mudah membuat scatter plot dengan menggunakan data dari dua frame.